Sequences
rcpg0_144034.y1reads
risp31_e15.y1est
rcsp03b_i3.y1est
rvin019_g23.y1est
ruio07_e9.y1est
risp04_f3.y1est
rfhi4015b_j5.y1est
CT172303reads
rpliv0131_e12.y1est
CR897461reads
recc2834c_h15.y1est
BX916310est
CB479142est
rfhi4021b_i14.y1est
AW477610est
CO942300est
rhlv21b_b4.y1est
rcga25b_o15.y1est
rtra13_n2r1.y1est
EST Library Info
cga1Galactophore - RNA from China
csp1Spleen - RNA from China
ecc1Foetus 50 days, cortex cerebri
fhi2Unavailable
hlv1Heart, left ventricle
isp2M. Infraspinatus
pliv1Unavailable
tra1Trachea
uio1Unavailable
vin1M. Vastus intermedius
Clusters
BGISUSX0000172488
BGISUSX0000172477
Oligos
BGISUSO0000005848
SNPs

Gene ID ENSG00000198743 (click for geneview)
Transcript ID ENST00000362077(link to ensembl)
Symbol MRPS6
Localtion Chromosome:21:34419337:34437198:1 band: 21q22.11
Description Mitochondrial 28S ribosomal protein S6 (S6mt) (MRP-S6). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P82932]
Phylogenetic trees Goto TreeFam
Found Homolog YES

Show assembled from
↑ Human UTR Coding Intron   Pig Cluster reads Sequence EST Sequence Oligo  
↓Quality Color Table
not available >=0 - <20 >=20 - <40 >=40 - <60 >=60 - <80 >=80 - <100
<-----------------------><--------------------------------------------------------------------------
-K--F--S--L--S--F--I--L--K--H--K--Q--K--Q--P--E--T--A--A--T--L--K--R--T--I--E--A--L--M--D--R--G--A--
AAATTCTCTCTCTCTTTTATTTTAAAACACAAACAAAAACAGCCAGAGACTGCTGCTACTTTGAAACGTACGATAGAGGCCCTGATGGACAGAGGAGCAA
                                                                                    :::::: ::::.:: .
------------------------------------------------------------------------------------ATGGACCGAGGGGCTG
-------------------------------------------------------------------------------------M--D--R--G--A--

---------------------------------------------------------------------------------><-----------------
I--V--R--D--L--E--N--L--G--E--R--A--L--P--Y--R--I--S--A--H--S--Q--Q--H--N--R--G--G--Y--F--L--V--D--F
TAGTGAGGGACTTGGAAAACCTGGGTGAACGAGCGCTTCCTTATAGGATCTCTGCCCACAGTCAGCAGCACAACAGAGGCGGGTATTTCTTGGTGGATTT
::::::::.:::::::.::::::::.::.:: ..::::::.::.:.::::::::::::::.:::::.::::  :::.:::   :::::::::::::::::
TAGTGAGGAACTTGGAGAACCTGGGCGAGCGCATGCTTCCCTACAAGATCTCTGCCCACAATCAGCGGCACTCCAGGGGC---TATTTCTTGGTGGATTT
V--V--R--N--L--E--N--L--G--E--R--M--L--P--Y--K--I--S--A--H--N--Q--R--H--S--R--G-----Y--F--L--V--D--F

----------------------------------------------------------------------------------------------------
--Y--A--P--T--A--A--V--E--S--M--V--E--H--L--S--R--D--I--D--V--I--R--G--N--I--V--K--H--P--L--T--Q--E-
TTATGCACCCACCGCAGCTGTTGAAAGCATGGTGGAGCACTTGTCTCGAGATATAGATGTGATTAGAGGGAATATTGTCAAACACCCTCTGACCCAGGAA
:::::::::  : .::.::::::::::::::.:::::::.:::::::::::.:: ::::::::::::  ::::::.:: :::::.:::.:::::::::::
TTATGCACCACCAACAACTGTTGAAAGCATGATGGAGCATTTGTCTCGAGACATTGATGTGATTAGACCGAATATCGTAAAACATCCTTTGACCCAGGAA
--Y--A--P--P--T--T--V--E--S--M--M--E--H--L--S--R--D--I--D--V--I--R--P--N--I--V--K--H--P--L--T--Q--E-

-------------------------------------------------------------------------->
-L--K--E--C--E--G--I--V--P--V--P--L--A--E--K--L--Y--S--T--K--K--R--K--K--*-
CTAAAAGAATGTGAAGGGATTGTCCCAGTCCCACTCGCAGAAAAATTATATTCCACAAAGAAGAGGAAGAAGTGA
 :.:::::.:::::::::::.:::::.::::: :::: ::::::..:.:::::::: ::::::::.:::      
GTGAAAGAGTGTGAAGGGATCGTCCCGGTCCCCCTCGAAGAAAAGCTGTATTCCACCAAGAAGAGAAAG------
-V--K--E--C--E--G--I--V--P--V--P--L--E--E--K--L--Y--S--T--K--K--R--K-------

Pig Consensus Sequence

>BGISUST0000899721
------------------------------------------------------------------------------------ATGGACCGAGGGGCTG
TAGTGAGGAACTTGGAGAACCTGGGCGAGCGCATGCTTCCCTACAAGATCTCTGCCCACAATCAGCGGCACTCCAGGGGC---TATTTCTTGGTGGATTT
TTATGCACCACCAACAACTGTTGAAAGCATGATGGAGCATTTGTCTCGAGACATTGATGTGATTAGACCGAATATCGTAAAACATCCTTTGACCCAGGAA
GTGAAAGAGTGTGAAGGGATCGTCCCGGTCCCCCTCGAAGAAAAGCTGTATTCCACCAAGAAGAGAAAG------


>BGISUSP0000899721
----------------------------MDRGAVVRNLENLGERMLPYKISAHNQRHSRG-YFLVDFYAPPTTVESMMEHLSRDIDVIRPNIVKHPLTQE
VKECEGIVPVPLEEKLYSTKKRK--